自治醫(yī)科大學(xué)最初在1972年設(shè)立之時(shí)的目標(biāo)是，確保和提高偏遠(yuǎn)地區(qū)的醫(yī)療體系，并且增進(jìn)當(dāng)?shù)鼐用竦母ｌ?。學(xué)校的教育目的是培養(yǎng)堅(jiān)持醫(yī)療道德，并且同時(shí)具有較高臨床實(shí)力的醫(yī)師，以醫(yī)學(xué)的進(jìn)步和提高當(dāng)?shù)刈∶竦母ｌ頌槭姑?。自治醫(yī)科大學(xué)是由在地域醫(yī)療體系中負(fù)責(zé)的全國(guó)各都道府縣共同創(chuàng)立的學(xué)校法人進(jìn)行運(yùn)營(yíng)的。本校的學(xué)生們，可以通過(guò)在校6年時(shí)間的住校生活，共同的起居，蘊(yùn)育出自律協(xié)調(diào)的精神和責(zé)任感。同時(shí)，通過(guò)加強(qiáng)與都道府縣的聯(lián)系，努力使學(xué)生們加深對(duì)偏僻地域醫(yī)療現(xiàn)狀的認(rèn)識(shí)，鞏固對(duì)人道醫(yī)療的使命感。