據(jù)清《崖州志》載，宋開寶五年（972年）振州（今三亞一帶）改為崖州，隸瓊州。宋熙寧六年（1073年），改崖州為珠崖軍。宋政和七年（1117年），改珠崖軍為吉陽(yáng)軍。明清兩代則一直沿用 “崖州”。歷經(jīng)建置沿革變遷，崖城古鎮(zhèn)一直是歷代州、軍治和民國(guó)政府所在地。

1950年崖縣解放，崖縣人民政府在崖城成立。[3]

1954年建崖城鎮(zhèn)，1958年改立炮艇公社，1984年復(fù)置鎮(zhèn)。

2001年8月，崖城鎮(zhèn)、保港鎮(zhèn)、梅山鎮(zhèn)、雅亮鄉(xiāng)合并，設(shè)立崖城鎮(zhèn)。

2014年1月25日，國(guó)務(wù)院批復(fù)同意海南省撤銷三亞市所轄六鎮(zhèn)，新設(shè)四個(gè)市轄區(qū)[4] 。其中同意撤銷三亞市崖城鎮(zhèn)，設(shè)立三亞市崖州區(qū)，以原崖城鎮(zhèn)的行政區(qū)域?yàn)檠轮輩^(qū)的行政區(qū)域，崖州區(qū)人民政府駐水南大道288號(hào)。[5]

2014年10月23日，三亞市人大常委會(huì)第二十五次會(huì)議決定：分別成立三亞市吉陽(yáng)區(qū)、海棠區(qū)、天涯區(qū)、崖州區(qū)第一屆人民代表大會(huì)籌備組，負(fù)責(zé)籌備各本區(qū)第一屆人民代表大會(huì)相關(guān)事宜。

2015年1月2日，三亞市崖州區(qū)舉行成立大會(huì)暨揭牌儀式，崖州區(qū)黨委、區(qū)人大、區(qū)政府正式掛牌成立。

2007年5月，崖城鎮(zhèn)被建設(shè)部、國(guó)家文物局公布為第三批中國(guó)歷史文化名鎮(zhèn)。

打柴舞是黎族民間最具代表性的舞種，黎語(yǔ)稱轉(zhuǎn)剎、太剎。它起源于古崖州地區(qū)(今海南省三亞市)黎族的喪葬習(xí)俗。打柴舞是黎族最古老、最受歡迎的舞種之一。黎語(yǔ)轉(zhuǎn)剎，起源于古崖州黎族喪葬活動(dòng)，系黎族古代人在死時(shí)用